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华体会网页版 - 重磅!携手浙大,赛默飞自动化强势助力国内合成生物学研究
加载中... 日期:2023-08-24

2022年7月16日, iBioFoundry合成生物学主动化体系于杭州萧山,同首届工程生物锻造论坛浩繁专家学者晤面。该体系为年夜范围、高集成度的全流程、高通量、主动化合成生物学装配,由赛默飞协助浙江年夜学杭州国际科创中央搭建。

图1.海内合成生物学范畴的专家学者齐聚一堂

事实上,赛默飞深耕试验室主动化范畴近30年,拥有富厚的合成生物学主动化体系搭建经验:

2014年,美国伊利诺伊年夜学厄巴纳-喷鼻槟分校,主动化合成生物学体系:iBioFAB2016年,德国格莱夫斯瓦尔德年夜学,主动化生物酶筛选体系:LARA2019年,加拿年夜康考迪亚年夜学,DNA组装技能研究平台:GenomeFoundry……

甚么是合成生物学?为什么云云备受青睐?

合成生物学现实上是基于生命体系的工程技能,其目的是改造、创造新的生物模块以及生物体系,从而为人类办事。作为继份子生物学革命以及基因组学革命以后的“第三次生物技能革命”,其愈来愈遭到学术界以及财产界的存眷,可谓2022年生命科学热点赛道!

尽人皆知,合成生物学研究触及很多高通量以及高精度的试验流程,是以对于主动化的需求较高。

一 iBioFoundry 合成生物学主动化体系

2022年,浙江年夜学杭州国际科创中央

iBioFoundry按样本库、细胞筛选及造就、DNA元件组装以及阐发检测四年夜功效模块集成设计,可广泛运用于基因回路的设计构建、人工基因设计合成、细胞工场设计构建、多细胞系统构建与运用、酶份子定向进化、无细胞卵白合成、化合物合成与筛选、生物质料创制等多个研究标的目的。

图2.iBioFoundry合成生物学主动扮装置

使用该装配可有用提高人工细胞构建效率,进一步深度交融生命科学以及信息科学,到达快速创造数据、智能阐发数据和数据驱动再创造的方针,实现人工合成系统的精准设计、尺度合成与切确调控。

论坛上,海内合成生物学专家学者观光了iBioFoundry体系并给出了高度评价,并期待这套体系可以或许促成合成生物技能在生物制造以及生命康健等范畴的交融与运用,并为鞭策我国工程生物学走向更高程度,赋能处所经济高质量成长做出孝敬。

2、主动化合成生物学体系iBioFAB

2014年,美国伊利诺伊年夜学厄巴纳-喷鼻槟分校

2014年,赛默飞协助美国伊利诺伊年夜学厄巴纳-喷鼻槟分校的赵惠平易近传授试验室搭建了iBioFAB主动化合成生物学体系,其旨在经由过程将人工智能/呆板进修与主动化相联合,来用以加快生物工程的研究进程。

图3.合成生物学主动化体系iBioFAB:

Design-Build-Test-Learn的主动化轮回

3、主动化生物酶筛选体系LARA

2016年,德国格莱夫斯瓦尔德年夜学

赛默飞协助格莱夫斯瓦尔德年夜学搭建了LARA体系,该平台运用于生物催化研究中,可实现卵白质工程突变体库的高通量筛选。

图4. LARA体系的平台结构

4、DNA组装技能研究平台Genome Foundry

2019年,加拿年夜康考迪亚年夜学

康考迪亚年夜学的该平台是一个高度主动化的DNA组装技能研究平台,可实现GoldenGate组装、CRISPR/Cas9试验以及酵母重组。此外该体系还可实现RNA-Seq的文库制备流程。

图5.基于ThermoScientific inSPIRE 平台的主动化ConcordiaGenome Foundry体系

生命科学以及信息科学深度交融,创造无穷可能

虽然主动化在工业范畴盛行已经久,可是运用于生命科学,出格是合成生物学时间其实不算长。究其缘故原由,是由于生命科学范畴的主动化出现出联系关系装备多,流程繁杂,触及的容器种类繁多等特色。患上益于富厚的行业经验,赛默飞可应答差别流程需求提供成熟的生命科学主动化解决方案。

而此中,ThermoScientific Momentum 中心节制软件犹如“智能年夜脑”,可以与外部算法步伐举行联系关系,经由过程将主动化与呆板进修相联合,研究者可以或许更精准地举行猜测以及摸索。

主动化体系不仅能以高通量的体式格局摸索此中的每一一种可能性,也能够不停地缩小规模,追求此中体现好的子集。这是生命科学以及信息科学深度交融的活泼实证,也是此后聪明型试验室的成长标的目的。

一路赋能聪明试验室,配合联袂向将来!

图片来历

图1.浙年夜杭州科创中央:https://mp.weixin.qq.com/s/wfX9BDJd-GoGr3CBi6iCXQ

图2.浙年夜杭州科创中央:https://mp.weixin.qq.com/s/wfX9BDJd-GoGr3CBi6iCXQ

图3.ChaoR,ShekharM,TongS,ZhaoHM.Engineeringbiologicalsystemsusingautomatedbiofoundries.MetabolicEngineering42(2017)98–108.http://dx.doi.org/10.1016/j.ymben.2017.06.003

图4.MarkD,MichaelP.C.F.etal.FullyAutomatizedHigh-ThroughputEnzymeLibraryScreeningUsingaRoboticPlatform.BiotechnologyandBioengineering,DOI10.1002/bit.25925