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华体会网页版 - 组学分析又添利器——肥胖和2型糖尿病患者肠道病毒组变化研究
加载中... 日期:2023-03-16

文章标题:揭晓期刊:Gastroenterology揭晓时间:2021年6月影响因子:22.68 研究配景 肥胖以及2型糖尿病(T2DM)患病率的不停升高一直是全世界大众卫生的挑战,据预计,2016年全世界有6.5亿肥胖患者。肥胖能引起2型糖尿病以及心脑血管疾病等疾病的发生,虽然前期的研究已经经报导肥胖以及T2DM的发生以及肠道细菌构成的变化有关,可是肠道中病毒的变化对于T2DM的影响还不清晰。喷鼻港中文年夜学的Siew C Ng传授团队揭晓文章阐发了肥胖个别中患T2DM以及不患T2DM患者肠道病毒转变特性。详细的研究内容咱们一路来看一下吧。本研究从喷鼻港以及昆明招募了229名成年受试者,收拾整顿样本的地域、性别、春秋、T2DM等相干信息,网络粪便样本并基于鸟枪法宏基因组测序技能举行宏基因及宏病毒组的检测阐发。 研究成果 1.肥胖患者的肠道病毒多样性有较着的变化从肥胖以及瘦且康健比照组的病毒的α多样性指数来看,肥胖组的肠道病毒群品貌(Chao1)低于瘦且康健比照组(p = .0076,图1A)。然而,肥胖组以及瘦且康健比照组之间的病毒多样性(Shannon)变化不显著(p = .049,图1B)。为此,进一步比力了地舆因素对于肠道菌群的影响。研究发明,HK行列步队肥胖者的α多样性(Chao1以及Shannon)低于瘦且康健比照组。比拟之下,在KM行列步队中,肥胖者以及瘦且康健比照组之间的肠道病毒多样性没有显著差异。PCoA阐发显示,与瘦比照组比拟,HK行列步队肥胖受试者肠道病毒谱的变化更显著。成果也进一步注解,肥胖在病毒变化历程中有主要作用,同时病毒的变化也受地区因素的影响;此外,对于春秋以及性别因素的考查发明,二者对于病毒影响较小。在病毒序列中,有尾病毒目Caudovirales在肥胖受试者以及瘦康健比照组的肠道病毒中占主导职位地方(图1C)。校订T2DM以及行列步队因素后,发明有11种病毒在肥胖组中富集,此中Escherichia phage,Geobacillus phage以及Lactobacillus phage的相对于品貌最年夜。图1.肥胖患者肠道病毒多样性成果2.糖尿病可致使肥胖病人肠道病毒转变经由过程比力Ob-non-T2组、ObT2组以及瘦康健比照组的α多样性,发明Ob-non-T2组以及瘦康健比照组的Chao1指数以及Shannon多样性指数没有显著变化(图2B);ObT2的Chao1指数显著降低(图2A)。同时,ObT2中的病毒富厚度以及多样性在HK行列步队中降低,但在KM行列步队中变化不较着,注解地舆因素可能与肠道病毒变化有关。此外,从PCoA分成果可看出,ObT2与 Ob-non-T2组以及瘦康健比照组较着分隔,也进一步注解ObT2的肠道病毒构成发生了变化(图2C)。进一步对于药物的研究发明,降血糖以及血脂药物对于肠道病毒的影响较少。末了也发明了17种与ObT2相干的病毒,如在ObT2中增长的Micromonas pusilla virus 以及Cellulophaga phage等,和削减的Bacteroides phage 以及Hokovirus 等;别的,也发明了28种与糖尿病相干的病毒;由图2E可看出,肥胖以及ObT2没有共有的差异病毒,且与ObT2相干的差异病毒都来自T2DM。图2.Ⅱ型糖尿病对于肥胖患者肠道病毒影响成果3.肥胖以及T2DM患者肠道菌群的转变对于肥胖以及瘦组间的研究发明,二者间的α多样性未发生显著变化,但属程度的Prevotella、Leptothrix以及Tetragenococcus halophilus等菌在肥胖人群中升高,Parascardovia denticolens 菌降低。为了验证T2DM对于肠道菌群的影响,作者进一步比力了Ob-non-T2组、ObT2以及瘦康健比照组的肠道菌。从PCoA成果可看出,三组间肠道菌群有较着不同(图3C)。虽然ObT2组的Shannon指数高于Ob-non-T2组(图3B),但并未发明ObT2受试者以及瘦康健比照组之间的α多样性指数有显著变化(图3A以及图3B)。ObT2组的菌在门、目、科以及属程度上显著变化,此中属程度上有20个菌与ObT2显著相干且相对于含量>0.1%,。图3. Ⅱ型糖尿病对于肥胖患者肠道细菌影响成果4.肥胖以及T2DM患者中病毒-细菌相干性降低对于细菌以及病毒间进一步的相干性阐发发明,肥胖组病毒以及细菌的相干性相对于于正常组降低(图4A,4B),正显著相干的细菌-病毒中,瘦康健比照组中据有86.8%,而肥胖组中只有31.3%。由此可看出,肥胖不仅致使有相干性的细菌-病毒数目削减,正相干以及负相干的比例也响应削减。而相干性数目的削减重要由Myoviridae, Siphoviridae以及unclassified family与Firmicutes间相干性引起(图4A,4B),出格是Streptococcus phage与宿主Streptococcus pneumoniae在瘦康健比照组间有强正相干性,但在肥胖组中显著降低。此外,还发明宿主为与代谢疾病相干假单胞菌的噬菌体与有利菌在瘦比照组中显著正相干。与T2DM相干的细菌-病毒相干性阐发成果显示,Ob-non-T2以及ObT2组中显著负相干的数目相对于于瘦康健比照组均增多,但ObT2组负相干的数量削减。噬菌体-细菌在差别组间阐发的成果注解,噬菌体-病毒总相干性数目在ObT2组中削减,Ob-non-T2以及ObT2组中负相干性数量增长。图4.肠道细菌以及病毒相干性阐发成果 总结 本研究初次展现了肥胖人群肠道病毒的变化,也发明2型糖尿病可加剧肥胖相干的病毒特性;此外,对于HK以及KM人群的研究也进一步注解地区因素对于肠道病毒的影响,但肠道病毒在肥胖与T2DM的病发机制另有待进一步研究。 文献原文下载链接:提取码:c3b1